近日,中科院海洋所王海艷研究團隊綜合利用分子生物學和形態(tài)學方法對廣義簾蛤科(以下簡稱簾蛤科s.l.)貝類分類和系統(tǒng)發(fā)育進行了研究,研究成果“The new phylogenetic relationships in Veneridae (Bivalvia: Venerida)”發(fā)表于TOP期刊-林奈學會動物學雜志Zoological Journal of the Linnean Society上。
簾蛤科s.l.系統(tǒng)發(fā)育分析:左圖為基于線粒體全基因組數(shù)據(jù)構(gòu)建的簾蛤科系統(tǒng)發(fā)育樹及基因排列順序;右圖為基于多基因短片段構(gòu)建的簾蛤科系統(tǒng)發(fā)育樹
簾蛤科s.l.是海洋雙殼貝類中經(jīng)濟價值較大、多樣化水平較高的類群。由于其分布范圍極廣、生境類型多樣、形態(tài)變異較大,導致依據(jù)傳統(tǒng)形態(tài)分類方法建立的簾蛤科分類及其系統(tǒng)演化存在較大爭議,這阻礙了其他相關(guān)研究的發(fā)展。該研究分別使用148個物種的多基因片段(cox1-16S-h3-28S)和37個物種的49條線粒體全基因組序列構(gòu)建系統(tǒng)演化樹,是當前簾蛤科系統(tǒng)演化領(lǐng)域中覆蓋類群和使用分子標記最多的研究。
基于系統(tǒng)演化研究結(jié)果,結(jié)合線粒體基因組功能基因組成和排列順序、貝殼形態(tài)等特征,發(fā)現(xiàn)簾蛤科s.l.物種分成了兩個支持度較高的支系(支系A(chǔ)和B),分別包含4個和10個亞科。研究建議將簾蛤科s.l.分成兩個科:支系A(chǔ)為簾蛤科Veneridae,典型特征為殼表通常具有形態(tài)變化較大的同心肋;支系B為文蛤科Meretricidae,典型特征為殼表通常光滑或有較弱的同心刻紋。對常見簾蛤科貝類的分類地位進行了修訂和完善,支持仙女蛤亞科Callistinae和卵蛤亞科Pitarinae為有效亞科;雪蛤?qū)貾lacamen歸入鏡蛤亞科Dosiniinae;皺紋蛤?qū)貾eriglypta歸入簾蛤亞科Venerinae,凸卵蛤?qū)貾elecyora歸入卵蛤亞科,光殼蛤?qū)貺ioconcha和齒紋卵蛤?qū)貶yphantosoma歸入美女蛤亞科;鱗杓拿蛤歸入帝汶蛤?qū)賂imoclea,拉丁名更改為Timoclea squamosus,同時將杓拿蛤?qū)貯nomalodiscus 降為帝汶蛤?qū)俚膩唽伲粚⒘鸭y格特蛤和日本格特蛤歸入綴錦蛤?qū)僦校⒏麨榱鸭y綴錦蛤Tapes hiantina和日本綴錦蛤Tapes japonica;將日本閉殼蛤Claudiconcha japonica移出住石蛤亞科;確定加夫蛤Gafrarium pectinatum和凸加夫蛤Gafrarium tumidum為兩個獨立有效的種。該研究澄清了國際同行關(guān)注的簾蛤科貝類系統(tǒng)發(fā)育的難點和焦點問題,具有一定的創(chuàng)新性。
研究還發(fā)現(xiàn),多基因短片段適用于較低階元的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系研究,而線粒體基因組數(shù)據(jù)能夠解決更高階元之間的演化關(guān)系。此外,簾蛤科貝類線粒體基因組功能基因排列順序表現(xiàn)出與系統(tǒng)發(fā)育高度相關(guān)的保守性,可以作為衡量簾蛤科貝類物種間演化關(guān)系的重要依據(jù)。
研究得到了國家重點研發(fā)項目、國家自然科學基金、中科院戰(zhàn)略性先導科技專項等項目資助。劉玉盟博士為論文第一作者,王海艷研究員為論文通訊作者。
文章鏈接:https://academic.oup.com/zoolinnean/advance-article-abstract/doi/10.1093/zoolinnean/zlac047/6619051